生命情報学
| 担当者 ： | 曹 纓、由良 敬 |
| 講義時期： | 平成25年度前期集中 土曜 13:20〜18:10（5月11日開講） |
| 講義場所： | ITルーム５（共通講義棟1号館１階） |
| 講義の特徴： | 本講義では、生命情報学の入門として、近年生命科学で重要である大規模情報の基礎を学び、ゲノムに立脚したデータ解析を学ぶ。また、近年インターネットを通じてデータが提供されていること、およびデータ解析の自動化が重要であることに着目して、ネットワークを介したデータの取得方法ついて議論する。本講義では実際にコンピュータを利用して演習を行うため、受講生は各自コンピュータを持参してほしい。 |
| レベル： | 基礎的〜先端的 |
| 講義内容： |
| 回数 | 日時 | 内容 | 担当者 |
|---|---|---|---|
| 1-3 | 5月11日 13:20-18:10 |
イントロダクション UNIX基礎、ゲノムビューアの利用 | 曹 纓 由良 敬 |
| 4-6 | 5月18日 13:20-18:10 |
相同性検索のセットアップと利用 相同性検索(EMBOSS-Dotplotなど) | 曹 纓 由良 敬 |
| 7-9 | 5月25日 13:20-18:10 |
分子系統学入門 （fetchdb.py） | 曹 纓 由良 敬 |
| 10-12 | 6月1日 13:20-18:10 |
分子系統学実践 | 曹 纓 由良 敬 |
| 13-15 | 6月8日 13:20-18:10 |
分子系統解析総集編 参考文献、参考データ１、参考データ２ | 曹 纓 由良 敬 |
| 単 位 ： | ２単位（博士前期課程・博士後期課程） |
| 成績評価： | 講義への出席状況とレポート |
受講について
生命情報学副専攻でレンタルされているMacBookProまたはご自分のMacBookProを持参してください。