生命情報学
| 担当者 ： | 瀬々 潤 |
| 講義時期： | 平成２２年８月９日〜１２日，１８日 |
| 講義時間： | １３：２０ 〜 １８：１０ | 講義場所： | 人間文化創成科学研究科・全学供用研究棟5FSCS室 |
| 講義目的： | 本講義では、生命情報学の入門として、近年生命科学で重要である大規模情報の基礎を学び、ゲノムに立脚したデータ解析を学ぶ。また、近年インターネットを通じてデータが提供されている事、及びデータ解析の自動化が重要である事に着目し、ネットワークを含めてデータ解析を自動化する手法とその改良について議論する。本講義では実際にコンピュータを利用して演習を行うため、受講生は各自コンピュータを持参して欲しい。 |
| 講義内容： | １．イントロダクション |
| ２．UNIX基礎、ゲノムビューアの利用 | |
| ３．相同性検査のセットアップと利用 | |
| ４．相同性検索（EMBOSS-Dotplot） | |
| ５．Web API(Google Chart API, TogoWS REST) | |
| ６．WebAPI(TogoWS SOAP) | |
| ７．相同性検索と周辺処理の自動化 | |
| ８．統計処理の基礎 | |
| 単位 ： | ２単位 |
| 成績評価： | 講義への出席状況とレポート |
受講について
生命情報学副専攻でレンタルされているMacBookを持参してください。また、授業に先立って配布されるセットアップ資料に従って計算機をセットアップの上、受講してください。
副専攻レンタルMac以外を持参することも可能です。上記資料に沿ってセットアップをして持参してください。ただしOS等のバージョンによって挙動が異なることがあるので、そのようなトラブルは各自解決してください。