開講：２００９年１０月１日（木）〜２月７日（木）７・８限

場所：理学部１号館５階４０１号室 （シラバスから変更）

内容：ゲノム塩基配列データおよびタンパク質立体構造データなどを用いて、タンパク質の分子進化や構造機能に関する情報をどのように抽出するかを演習する。具体的には、ＰＣ（貸し出し可）でPythonを用いてプログラムを作りながら、生命科学データの統計解析を実習する。各９０分の前半では、統計手法とプログラムの作り方の解説し、後半では各人がプログラミングとデータの解釈を実習する。可能な限り各回を独立のトピックスにする予定だが、プログラミング技術は積み上げて勉強しなければならない。１月に試験問題を公開し、２月７日までに解答を提出すること。出席と試験結果にもとづいて、成績評価を行う。

授業進行予定と状況：

• １０月０１日（木）　登録のみ

• １０月０８日（木）　第０１回　講義演習　（台風Melorの通過のため休講）

• １０月１５日（木）　第０２回　講義演習：プログラミングと統計解析(1)（pythonの使い方(1)）

• １０月２２日（木）　第０３回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：プログラミングと統計解析(2)（pythonの使い方(2)）

• １０月２９日（木）　第０４回　自習（Deinococcus radioduransのマイクロアレーデータを解析）(プログラム例）

• １１月０５日（木）　第０５回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：中心極限定理

• １１月１２日（木）　第０６回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：サンプリング (コンピュータ実験）

• １１月１９日（木）　第０７回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：χ二乗分布と検定（練習問題）

• １１月２６日（木）　第０８回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：ｔ分布

• １２月０３日（木）　学内の生命情報シンポジウムを聴講（理学部３号館２階）

• １２月１０日（木）　第０９回　演習：t検定を使いこなす

• １２月１７日（木）　この日は月曜日の時間割日

• ０１月１４日（木）　第１０回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：分散分析（ANOVA）その１

• ０１月２１日（木）　第１１回　自習

• ０１月２８日（木）　第１２回　講義演習（理学部３号館２Fラウンジ）：分散分析（ANOVA）その２

• ０２月０４日（木）　第１３回　講義演習（共通講義棟ＩＴルーム５）（試験を出題）：

• ０２月０８日（月）　解答メール提出締切日