生命情報学
| 担当者 ： | 由良 敬 |
| 講義時期： | 平成24年4月28日、5月12日、19日、6月2日、9日 |
| 講義場所： | ITルーム５（共通講義棟1号館１階） |
| 講義時間： | ５〜１０限 (13:20〜18:10) |
| 講義目的： | 本講義では、生命情報学の入門として、近年生命科学で重要である大規模情報の基礎を学び、ゲノムに立脚したデータ解析を学ぶ。また、近年インターネットを通じてデータが提供されていること、およびデータ解析の自動化が重要であることに着目して、ネットワークを含めてデータ解析を自動化する手法とその改良について議論する。本講義では実際にコンピュータを利用して演習を行うため、受講生は各自コンピュータを持参してほしい。 |
| 講義内容： |
| 回 | 日時 | 内容 |
|---|---|---|
| 1-3 | 4月28日 13:20-18:10 |
イントロダクション UNIX基礎、ゲノムビューアの利用 |
| 4-6 | 5月12日 13:20-18:10 |
相同性検索のセットアップと利用 相同性検索(EMBOSS-Dotplot) |
| 7-9 | 5月19日 13:20-18:10 |
API, PostScript, PythonとEMBOSS |
| 10-12 | 6月2日 13:50-18:10 |
統計処理の基礎 |
| 13-15 | 6月9日 13:20-18:10 |
相同性検索から系統樹の作成まで |
| 単 位 ： | ２単位（博士前期課程・博士後期課程） |
| 成績評価： | 講義への出席状況とレポート |
受講について
生命情報学副専攻でレンタルされているMacBookProまたはご自分のMacBookProを持参してください。