1zs8A

histocompatibility 2, m region locus 10.5 [1zs8] A chain

Surroundedness Factor
3D Structure
Raw data

Backbone structure of the protein. White subunit is in consideration.
Red region has high SF value. Space filling model is the N- and C-teminal residues.

Raw SF value of each residue

#	aa	SF
1	Ser	0.00
2	His	0.00
3	Trp	0.02
4	Leu	0.04
5	Lys	0.09
6	Thr	0.13
7	Phe	0.18
8	Arg	0.19
9	Ile	0.21
10	Val	0.19
11	Ile	0.21
12	Met	0.19
13	Glu	0.19
14	Pro	0.22
15	Gly	0.34
16	Ile	0.37
17	Leu	0.36
18	Glu	0.37
19	Pro	0.33
20	Arg	0.22
21	Phe	0.15
22	Ile	0.16
23	Gln	0.14
24	Val	0.14
25	Ser	0.11
26	Tyr	0.09
27	Val	0.07
28	Asp	0.06
29	Ser	0.07
30	Ile	0.08
31	Gln	0.09
32	Tyr	0.09
33	Gln	0.09
34	Gly	0.10
35	Phe	0.14
36	Asp	0.25
37	Ser	0.37
38	Arg	0.38
39	Ser	0.35
40	Gly	0.30
41	Met	0.19
42	Gln	0.07
43	Pro	0.05
44	Arg	0.04
45	Ala	0.04
46	Ala	0.03
47	Trp	0.01
48	Met	0.00
49	Lys	0.00
50	Gln	0.00
51	Glu	0.00
52	Pro	0.00
53	Pro	0.00
54	Glu	0.00
55	Tyr	0.01
56	Trp	0.00
57	Lys	0.00
58	Asn	0.01
59	Glu	0.03
60	Thr	0.04
61	Glu	0.04
62	His	0.07
63	Ala	0.12
64	Met	0.11
65	Gly	0.11
66	Ala	0.17
67	Ser	0.21
68	Leu	0.17
69	Leu	0.17
70	Ala	0.24
71	Arg	0.23
72	Arg	0.17
73	Thr	0.19
74	Leu	0.25
75	Ile	0.19
76	Tyr	0.15
77	Met	0.21
78	Val	0.23
79	Thr	0.15
80	Glu	0.16
81	Asn	0.15
82	Asn	0.08
83	Asn	0.04
84	Lys	0.04
85	Lys	0.04
86	Asn	0.10
87	Asp	0.14
88	Tyr	0.19
89	His	0.22
90	Thr	0.25
91	Leu	0.23
92	Gln	0.23
93	Glu	0.19
94	Val	0.16
95	Phe	0.10
96	Gly	0.06
97	Cys	0.02
98	Asn	0.02
99	Val	0.01
100	Ala	0.03
101	His	0.03
102	Asp	0.06
103	Gly	0.07
104	Ser	0.09
105	Phe	0.09
106	Leu	0.09
107	Gly	0.07
108	Gly	0.06
109	His	0.07
110	Tyr	0.08
111	Gly	0.11
112	Leu	0.12
113	Thr	0.20
114	Tyr	0.24
115	Tyr	0.23
116	Gly	0.21
117	Tyr	0.20
118	Asp	0.12
119	Tyr	0.07
120	Ile	0.06
121	Ile	0.05
122	Leu	0.04
123	Asn	0.03
124	Glu	0.02
125	Asp	0.01
126	Leu	0.01
127	Asn	0.00
128	Ser	0.00
129	Trp	0.01
130	Thr	0.01
131	Thr	0.01
132	Glu	0.01
133	Gly	0.01
134	Lys	0.01
135	Val	0.01
136	Gly	0.02
137	Gly	0.02
138	Lys	0.05
139	Phe	0.18
140	Asn	0.25
141	Ser	0.25
142	Val	0.27
143	Thr	0.28
144	Glu	0.15
145	Gly	0.09
146	Trp	0.08
147	Arg	0.05
148	Thr	0.01
149	Tyr	0.01
150	Leu	0.01
151	Lys	0.00
152	Gly	0.00
153	Glu	0.00
154	Cys	0.00
155	Thr	0.00
156	Glu	0.00
157	Arg	0.00
158	Phe	0.00
159	Leu	0.00
160	Arg	0.00
161	Cys	0.00
162	Leu	0.00
163	Asp	0.00
164	Leu	0.00
165	Gly	0.00
166	Lys	0.00
167	Glu	0.00
168	Thr	0.00
169	Leu	0.00
170	Leu	0.01
171	Arg	0.01
172	Ser	0.04
173	Asp	0.06
174	Ala	0.10
175	Pro	0.12
176	Arg	0.14
177	Thr	0.12
178	His	0.13
179	Val	0.12
180	Thr	0.15
181	His	0.19
182	Lys	0.20
183	Val	0.18
184	Thr	0.15
185	Val	0.10
186	Thr	0.05
187	Leu	0.04
188	Arg	0.06
189	Cys	0.07
190	Trp	0.10
191	Ala	0.13
192	Leu	0.13
193	Gly	0.10
194	Phe	0.09
195	Tyr	0.05
196	Pro	0.01
197	Ala	0.00
198	Asp	0.00
199	Ile	0.00
200	Thr	0.00
201	Leu	0.01
202	Thr	0.02
203	Trp	0.02
204	Lys	0.06
205	Arg	0.15
206	Asp	0.18
207	Gly	0.19
208	Lys	0.19
209	Asn	0.15
210	His	0.05
211	Thr	0.02
212	Gln	0.00
213	Asp	0.00
214	Met	0.01
215	Glu	0.05
216	Leu	0.12
217	Pro	0.16
218	Asp	0.29
219	Thr	0.45
220	Arg	0.60
221	Pro	0.83
222	Ala	0.93
223	Gly	0.85
224	Asp	0.71
225	Gly	0.57
226	Thr	0.33
227	Phe	0.21
228	Gln	0.18
229	Lys	0.16
230	Trp	0.12
231	Ala	0.06
232	Ala	0.03
233	Val	0.01
234	Val	0.01
235	Val	0.00
236	Pro	0.01
237	Phe	0.01
238	Gly	0.01
239	Glu	0.04
240	Glu	0.06
241	Leu	0.07
242	Arg	0.10
243	Tyr	0.11
244	Thr	0.13
245	Cys	0.14
246	His	0.17
247	Val	0.16
248	His	0.17
249	His	0.17
250	Glu	0.26
251	Gly	0.61
252	Leu	0.95
253	Pro	1.12
254	Gly	1.22
255	Pro	1.23
256	Leu	0.91
257	Thr	0.61
258	Leu	0.43
259	Lys	0.35
260	Trp	0.00
261	Gly	0.00

Go Back to the top